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窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析
段义忠 ; 张得钧 ; 高庆波 ; 张发起 ; 李印虎 ; 陈世龙
2010-04-15
发表期刊植物研究 ; 段义忠;张得钧;高庆波;张发起;李印虎;陈世龙.窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析,植物研究,2010,30(2):146-151
摘要 应用PCR产物直接测序法分析了窄叶鲜卑花居群间nrDNA (核糖体DNA) ITS序列和cpDNA (叶绿体DNA) trnL-F的碱基差异,并与cpDNA trnS-G序列和rpl20-rps12序列进行比较,从而初步研究两套植物基因组的变异速率。采用改良的CTAB法从硅胶干燥的窄叶鲜卑花叶片中提取总DNA,并对nrDNA ITS和cpDNA trnL-F区域进行扩增、纯化、测序。nrDNA ITS序列共有601 bp,有变异位点3处,变异位点百分率为0. 05% , ( G + C)含量为41. 4%。cpDNA trnL-F序列共有927 bp,有变异位点1处,变异位点百分率0. 01% , (G +C)含量为32. 6% ,两种序列的核苷酸多样性非常低。比较发现,窄叶鲜卑花nrDNA ITS区域较cpDNA trnS-G序列和rpl20-rps12序列保守,变异速率较慢,比cpDNA trnL-F序列变异速率稍快。通过对ITS序列单倍型( haplotype)进行分析发现,窄叶鲜卑花现有分布范围经历了居群近期范围扩张,与叶绿体基因组( trnS-G和rpl20-rps12序列)得出的结论一致。因此,窄叶鲜卑花nrDNA ITS序列适合该种的谱系地理学研究。
文献类型期刊论文
条目标识符http://210.75.249.4/handle/363003/21162
专题中国科学院西北高原生物研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
段义忠,张得钧,高庆波,等. 窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析[J]. 植物研究, 段义忠;张得钧;高庆波;张发起;李印虎;陈世龙.窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析,植物研究,2010,30(2):146-151,2010.
APA 段义忠,张得钧,高庆波,张发起,李印虎,&陈世龙.(2010).窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析.植物研究.
MLA 段义忠,et al."窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析".植物研究 (2010).
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