小麦眼斑病抗性基因Pch1 和供体的遗传图谱及Pch1 转移片段的遗传多样性

NWIPB OpenIR

	小麦眼斑病抗性基因Pch1 和供体的遗传图谱及Pch1 转移片段的遗传多样性
	魏乐
	2010-01
摘要	偏凸山羊草（Aegilops ventricosa Taush.，2n = 4x = 28; genomes DvDvMvMv）是小麦遗传改良的重要资源。小麦眼斑病抗性基因Pch1 基因就来源于偏凸山羊草7Dv 染色体，已广泛用于小麦眼斑病抗性育种。本研究构建了眼斑病抗性基因Pch1 和供体亲本的遗传连锁图谱，并分析了不同小麦具有的Pch1 转移片段的遗传多样性。 1．偏凸山羊草的遗传图谱构建以抗眼斑病的偏凸山羊草材料V10（具有眼斑病抗性基因Pch1）和对眼斑病中度感病的偏凸山羊草材料V7 杂交产生的135 个F8 代重组自交系为材料，利用42 对PstI/MseI AFLP（Amplified Fragment Length Polymorphisms）引物组合，扩增出了531 个多态性条带。根据457 个符合孟德尔1:1 分离比的标记位点，其中420 个PstI/MseI AFLP，31 个SSR，3 个其它AFLP，1 个STS，1 同功酶标记Ep-D1b，1 个形态标记即眼斑病抗性基因Pch1，首次构建了一个偏凸山羊草分子遗传连锁图谱。450 个位点分布于27 个连锁群，其中19 个为主连锁群（包含8~61 个标记），8 个为次连锁群（包含2~6 个标记）。另外还有5 个标记不连锁，2 个标记构成了一个伪连锁群，伪连锁群是几个间距为0 cM 的不同标记构成的连锁群。8 个次连锁群中有2 个二联体。27 个连锁群的总图距为2021.9 cM。每个连锁群的平均图距为74.9 cM。标记间距为0.0~44.5cM，平均间距为4.49 cM。标记数最多的为连锁群LG1-2，含有61 个标记，最少的为2 个标记。最长的连锁群LG1-2 的跨距为269.5 cM，最短的LG24 为0.4 cM。位于偏凸山羊草的7Dv染色体上的基因Pch1 被定位在LG3 连锁群上，表明该分子连锁群与偏凸山羊草的7Dv 染色体对应。该图谱为偏凸山羊草的遗传研究工作提供了重要基础。 2.眼斑病抗性基因Pch1 的高密度分子图谱构建了眼斑病抗性基因Pch1 区域的高密度分子标记连锁图谱。此图谱包含41 个AFLP 标记，2 个SSR 标记，1 个同功酶标记Ep-D1b，1 个抗病基因Pch1。Pch1 与14 个标记共分离，它们分别是Ep-D1b, aflp9HA, aflp16H, aflp7, aflp42,aflp34, aflp28, aflp27, aflp25HA, aflp19, aflp13, paflp3, aflp31, aflp2。这一共分离聚集群一侧是0.2~1.3 cM 的20 个AFLP 标记，另一侧是0.8~29.5 cM 的8 个AFLP和2 个SSR 标记。34 个与Pch1 共分离或相距1.3 cM 以内的AFLP 分子标记可被克隆、测序后，转化为特异性的SCAR 标记，用于进一步构建更高分辨率的Pch1 遗传连锁图谱及物理图谱，这些紧密连锁的标记还可用于标记辅助选择,提高抗病育种效率。 3. 不同小麦Pch1 转移片段的遗传多样性本实验采用小麦7D 染色体上的17 个位点特异性的SSR 标记（Simple Sequence Repeats or Microsatellites）分析了34 个含有Pch1 基因的小麦抗性品种，7 个不含Pch1 的小麦感病品种，Pch1 供体V10 和对眼斑病中度感病的V7。17 对引物扩增出25 个多态性位点，每一位点表现出2~17 个不同的等位形式。其中,14个位点将34 个小麦抗性品种划分为24 个单体型，表明这些位点在34 个小麦品种中的分布是连锁不平衡的。根据单体型,分析了Pch1 外源染色体转移片段在34 个小麦抗病品种中的变化,表明含Pch1 的外源染色体转移片段的长度在不同品种间存在差异，一些品种具有非常短的外源片段，这可能是在育种选择中丢失了不利的外源片段所致。通过连锁不平衡分析，发现了5 个可能与产量不利因素相关联的SSR 标记位点。此外,对3 个与Pch1 紧密连锁的SSR 标记（Xcfd175,Xwmc14, Xbarc97）作为辅助选择标记的实际应用价值进行了评估。
文献类型	学位论文
条目标识符	http://210.75.249.4/handle/363003/26496
专题	中国科学院西北高原生物研究所
推荐引用方式 GB/T 7714	魏乐. 小麦眼斑病抗性基因Pch1 和供体的遗传图谱及Pch1 转移片段的遗传多样性[D],2010.