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四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化
杨路存; 陈桂琛; 周国英; 宋文珠; 李春丽; 许璟瑛
2010-09-10
发表期刊生物技术通报
ISSN1002-5464
期号9页码:123-128
摘要摘 要: 采用正交试验与单因素设计相结合的方法, 对四数獐牙菜ISSR-PCR反应体系中的4 种主要因素(Mg2+ 、Taq DNA 聚合酶、dNTP及引物)进行优化筛选, PCR结果用统计软件SPSS16.0分析。结果显示, Mg2+ 、TaqDNA 聚合酶、dNTP这3因素的不同水平对PCR 反应结果都有显著影响, 其中Mg2+的浓度影响最大。筛选出各反应因素的最佳水平, 建立四数獐牙菜ISSR-PCR 反应的最佳体系( 25 uL)为3.0 mmol/L Mg2+ , 250 umol/L dNTP, 0.6 umol/L引物, 1U Taq DNA 聚合酶, 40 ngDNA, 21 5 LL 10 @bu ffer。这一体系的建立为今后利用ISSR 技术进行四数獐牙菜遗传多样性分析以及物种保护奠定了技术基础。 Abstract:An orthogonal design combined with single factor experiment was applied to optimize ISSR ( inter simple sequence repeat) -PCR ( polymerase cha inreaction) ampification system ofSwer tiatetraptera. The effect of the fourma in reaction system elements(Mg2 + , Taq DNA polymerase, dNTP and prime r) on ISSR-PCR were tested. The result of PCR analyzed by software SPSS16. 0, showed that the different levels ofMg2+ , Taq DNA polymerase, dNTP had an significant effect on the PCR reaction result and the concentration of Mg2+ was the most effective factor to the result of PCR. A most suitable ISSR2PCR system for S. tetraptera containing 3. 0mmol/LMg2 + , 250 Lmol/L dNTP, 016 Lmol/L pr imer, 1 U Taq DNA polymerase, 40ng DNA template and 21 5 LL 10 @buffe r in the total volume of 25 L L was established. The result could provide the basis for the analysis of diversity and protection ofS. tetraptera.
收录类别CSCD
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文献类型期刊论文
条目标识符http://210.75.249.4/handle/363003/2836
专题中国科学院西北高原生物研究所
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GB/T 7714
杨路存,陈桂琛,周国英,等. 四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化[J]. 生物技术通报,2010(9):123-128.
APA 杨路存,陈桂琛,周国英,宋文珠,李春丽,&许璟瑛.(2010).四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化.生物技术通报(9),123-128.
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