Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
| 基于磁珠富集法的绣线菊SSR分子标记分离与筛选 | |
张金华; Gulzar Khan; 付鹏程; 雷淑云; 陈世龙 ; 张发起
| |
| 2014 | |
| 发表期刊 | 生物学杂志
 |
| ISSN | 2095-1736 |
| 期号 | 3页码:79-83 |
| 摘要 | 微卫星序列(SSR)具有多态性高、共显性遗传等特点,是一种极具价值的分子遗传标记。采用磁珠富集法从高山绣线菊基因组DNA中分离和筛选SSR标记。高山绣线菊基因组经限制性内切酶Mse I酶切后与接头连接,并与生物素标记SSR探针(AC)15和(AG)15杂交,然后通过链霉亲和素磁珠富集、洗脱、PCR扩增、克隆,完成微卫星文库构建。利用载体通用引物和探针序列引物进行PCR扩增,筛选重组克隆并测序,获得112条序列。随机挑选其中60条序列设计的引物,经初期筛选获得多态性引物16对。用所得16对引物对4个居群92个个体的蒙古绣线菊和高山绣线菊进行PCR扩增。统计分析PCR产物的毛细管电泳结果,发现4个居群的平均等位基因数、平均期望杂合度及平均观测杂合度都比较高。64个数据系列(4个居群×16个位点)中的26个显著偏离HardyWeinberg平衡,推测可能由于无效等位基因的存在所引起。分析显示研究开发的16对多态性SSR引物可以用于后续遗传多样性、物种进化与亲缘关系等方面研究,丰富了绣线菊遗传多样性研究的分子标记。 |
| 关键词 | 绣线菊 微卫星 磁珠富集 遗传多样性 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://210.75.249.4/handle/363003/4094 |
| 专题 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张金华,Gulzar Khan,付鹏程,等. 基于磁珠富集法的绣线菊SSR分子标记分离与筛选[J]. 生物学杂志,2014(3):79-83. |
| APA | 张金华,Gulzar Khan,付鹏程,雷淑云,陈世龙,&张发起.(2014).基于磁珠富集法的绣线菊SSR分子标记分离与筛选.生物学杂志(3),79-83. |
| MLA | 张金华,et al."基于磁珠富集法的绣线菊SSR分子标记分离与筛选".生物学杂志 .3(2014):79-83. |
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| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 基于磁珠富集法的绣线菊SSR分子标记分离（1273KB） | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 浏览 下载 | |||
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