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利用转录组数据分析高原鼢鼠和裸鼹鼠基因的趋同进化
邓小弓; 王堃; 张守栋; 苏建平; 张同作; 林恭华
2014
Source Publication兽类学报
ISSN1000-1050
Issue2Pages:129-137
Abstract地下鼠由于长期适应于地下洞道生活,在诸多生物学特征上都产生了一定的趋同进化现象,但目前尚未在分子水平分析其趋同进化特征。本研究利用高通量测序数据,从氨基酸位点变化和基因表达量水平,分析两种亲缘关系较远的地下鼠———高原鼢鼠和裸鼹鼠的趋同进化。氨基酸位点变化分析显示,两种地下鼠的54个基因都存在至少一个理论趋同进化位点,其中13个基因可以找到相对明确的表型功能注释。基因表达量分析显示,两种地下鼠在转录组水平的总体表达模式上存在趋同效应;有103个基因在两种地下鼠脑中的表达量是作为对照的地上鼠(小鼠、豚鼠)表达量的3倍以上,其中有20个基因可以找到相对明确的表型功能注释。本研究的结果表明,高原鼢鼠和裸鼹鼠为了适应地下生活方式,在氨基酸序列和基因表达量水平上都产生了一定程度的趋同进化。其中,低氧适应相关基因(氧运输、氧代谢、DNA修复等)是地下鼠进化适应的最重要组成部分,挖掘器官(尤其是肌肉)功能相关基因的重要性次之,能量代谢及平衡相关基因也是地下鼠适应性进化的关键要素。
Keyword地下鼠 趋同进化 低氧适应 挖掘器官 能量代谢
Document Type期刊论文
Identifierhttp://210.75.249.4/handle/363003/4100
Collection中国科学院西北高原生物研究所
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GB/T 7714
邓小弓,王堃,张守栋,等. 利用转录组数据分析高原鼢鼠和裸鼹鼠基因的趋同进化[J]. 兽类学报,2014(2):129-137.
APA 邓小弓,王堃,张守栋,苏建平,张同作,&林恭华.(2014).利用转录组数据分析高原鼢鼠和裸鼹鼠基因的趋同进化.兽类学报(2),129-137.
MLA 邓小弓,et al."利用转录组数据分析高原鼢鼠和裸鼹鼠基因的趋同进化".兽类学报 .2(2014):129-137.
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