四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化

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	四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化
	杨路存 ; 陈桂琛 ; 周国英 ; 宋文珠 ; 李春丽 ; 许璟瑛
	2010-09-10
发表期刊	生物技术通报 ; 杨路存;陈桂琛;周国英;宋文珠;李春丽;许璟瑛.四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化,生物技术通报,2010,(9):123-128
摘要	摘要: 采用正交试验与单因素设计相结合的方法, 对四数獐牙菜ISSR-PCR反应体系中的4 种主要因素(Mg2+ 、Taq DNA 聚合酶、dNTP及引物)进行优化筛选, PCR结果用统计软件SPSS16.0分析。结果显示, Mg2+ 、TaqDNA 聚合酶、dNTP这3因素的不同水平对PCR 反应结果都有显著影响, 其中Mg2+的浓度影响最大。筛选出各反应因素的最佳水平, 建立四数獐牙菜ISSR-PCR 反应的最佳体系( 25 uL)为3.0 mmol/L Mg2+ , 250 umol/L dNTP, 0.6 umol/L引物, 1U Taq DNA 聚合酶, 40 ngDNA, 21 5 LL 10 @bu ffer。这一体系的建立为今后利用ISSR 技术进行四数獐牙菜遗传多样性分析以及物种保护奠定了技术基础。 Abstract:An orthogonal design combined with single factor experiment was applied to optimize ISSR ( inter simple sequence repeat) -PCR ( polymerase cha inreaction) ampification system ofSwer tiatetraptera. The effect of the fourma in reaction system elements(Mg2 + , Taq DNA polymerase, dNTP and prime r) on ISSR-PCR were tested. The result of PCR analyzed by software SPSS16. 0, showed that the different levels ofMg2+ , Taq DNA polymerase, dNTP had an significant effect on the PCR reaction result and the concentration of Mg2+ was the most effective factor to the result of PCR. A most suitable ISSR2PCR system for S. tetraptera containing 3. 0mmol/LMg2 + , 250 Lmol/L dNTP, 016 Lmol/L pr imer, 1 U Taq DNA polymerase, 40ng DNA template and 21 5 LL 10 @buffe r in the total volume of 25 L L was established. The result could provide the basis for the analysis of diversity and protection ofS. tetraptera.
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://210.75.249.4/handle/363003/41478
专题	中国科学院西北高原生物研究所
推荐引用方式 GB/T 7714	杨路存,陈桂琛,周国英,等. 四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化[J]. 生物技术通报, 杨路存;陈桂琛;周国英;宋文珠;李春丽;许璟瑛.四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化,生物技术通报,2010,(9):123-128,2010.
APA	杨路存,陈桂琛,周国英,宋文珠,李春丽,&许璟瑛.(2010).四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化.生物技术通报.
MLA	杨路存,et al."四数獐牙菜ISSR2PCR反应体系的正交优化".生物技术通报 (2010).