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ISSR分子标记揭示高原鼠兔种群的遗传多样性和遗传分化
葛艳丽
2009-06-01
摘要第一章 DNA分子标记技术概述 本章简要介绍了限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)、线粒体DNA标记(mtDNA)、微卫星标记(SSR)等几种常用的DNA分子标记技术,并重点介绍了简单序列区间扩增(ISSR)分子标记技术的原理、方法、特点及其在遗传研究中的应用。ISSR标记技术可以快速、高效、灵敏地检测基因组遗传信息,在动、植物遗传研究中具有广泛的应用前景。 第二章 高原鼠兔ISSR-PCR反应体系与反应条件的优化 以高原鼠兔(Ochotona curzoniae)基因组DNA为材料,分析了DNA浓度、Mg2+浓度、dNTP浓度、Taq酶浓度、引物浓度,以及引物的退火温度对ISSR-PCR扩增结果的影响,筛选出了扩增稳定、条带清晰、多态性丰富的5条ISSR引物,建立了高原鼠兔ISSR-PCR的最佳反应体系及PCR扩增条件,为利用ISSR标记技术开展高原鼠兔种群遗传多样性分析等工作奠定了基础。 第三章 ISSR分子标记揭示高原鼠兔种群的遗传多样性和遗传分化 高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是青藏高原特有的一种植食性小哺乳动物,在青藏高原高寒草甸生态系统的食物链中起着重要作用,同时也是该地区危害最为严重的优势物种之一。本研究采用建立的最佳的ISSR-PCR反应条件和扩增条件探讨了高原鼠兔(O. curzoniae)4个种群的遗传多样性和遗传分化。在11条ISSR引物中筛选了5条扩增稳定、条带清晰、多态性高的引物。共获得60条清晰条带,其中45条具有多态性,多态条带比(PPB)为75%。在种群水平上,Nei’s基因多样性(H)、Shannon指数(I)和多态带百分率(PPB)分别为0.1971、0.3036和66.67%;在物种水平上,Nei’s基因多样性(H)、Shannon指数(I)和多态带百分率(PPB)分别为0.2306、0.3531和75%。种群间分化系数为0.1453,基因流为2.9409。4个种群中当雄纳木错的遗传多样性较高,尼木续迈的遗传多样性较低。 AMOVA结果表明,种群内的遗传变异远大于种群间的遗传变异,种群分化不明显。在UPMGA聚类树上,雅鲁藏布江南岸的浪卡子和北岸的纳木错首先聚为一类,然后再与北岸的尼木聚为一类,南岸的另一个种群江孜则相对独立。另外,本研究还利用线粒体Cyt b基因序列简单分析了高原鼠兔种群的遗传结构。结果表明,在Cyt b基因,鼠兔种群分化明显,且UPMGA聚类分析也把江两岸的种群各聚为一类。两种结果的差异可能与这两种分子标记本身的特点相关,也可能与样本量,标记位点数等因素相关。
文献类型学位论文
条目标识符http://210.75.249.4/handle/363003/51830
专题中国科学院西北高原生物研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
葛艳丽. ISSR分子标记揭示高原鼠兔种群的遗传多样性和遗传分化[D],2009.
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