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利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征
雷淑芸; 张发起; Khan Gulzar; 王久利; 刘海瑞; 陈世龙
2015
Source Publication林业科学研究
Issue1Pages:37-43
Subtype期刊论文
Abstract利用Illumina Hi SeqTM2000平台对采自青海玉树的青杨进行高通量测序,SSR分析共获得7 067条SSR序列,复合型SSR共525条,发生频率0.149,平均跨度4 531.87 bp。SSR重复类型中,单核苷酸重复类型最多(33.96%);三核苷酸重复类型次之(31.00%);二核苷酸重复类型位居第三(27.69%);四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复类型SSR含量很少(<8%)。二核苷酸重复类型中,AG重复类型所占比例最高,GA次之,CT、TC则紧随其后;三核苷酸重复类型中,AAG重复类型所占比例最高,GAA次之,TTC、AGA、GAG、CAG、TCT、TGG等重复类型数量相...
Keyword青杨 青藏高原 高通量测序 微卫星 单核苷酸多态性
Funding Project西北高原生物研究所机构知识库
Document Type期刊论文
Identifierhttp://210.75.249.4/handle/363003/5390
Collection中国科学院西北高原生物研究所
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GB/T 7714
雷淑芸,张发起,Khan Gulzar,等. 利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征[J]. 林业科学研究,2015(1):37-43.
APA 雷淑芸,张发起,Khan Gulzar,王久利,刘海瑞,&陈世龙.(2015).利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征.林业科学研究(1),37-43.
MLA 雷淑芸,et al."利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征".林业科学研究 .1(2015):37-43.
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