Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
| 中国沙棘雌雄株叶片RNA-Seq转录组分析 | |
周武; 胡娜 ; 刘晓彤; 王煜伟; 索有瑞
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| 2019 | |
| 发表期刊 | 基因组学与应用生物学
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| 卷号 | 38期号:12页码:5516-5526 |
| 摘要 | 应用Illumina HiSeq测序技术,对中国沙棘雌雄株叶片分别进行了转录组测序,实验共获得48.31 G有效数据,平均错误率为0.015%。经Trinity软件混合拼接后共得到320 876条Transcripts和187 362条Unigenes,平均长度分别为808 bp和588 bp,最大长度均为17 291 bp。将Unigenes与公共数据库进行比对,得到注释的Unigenes为104 926条,占总数的56%。转录组数据经搜索共得到33 248个微卫星标记。中国沙棘雌株和雄株转录组基因表达量差异比较数据显示,雌雄样本间表达差异基因共92 970个。上述工作不仅为中国沙棘的基因克隆和基因挖掘提供了基础数据,也为初步阐明中国沙棘性别决定的分子机制打下了基础。 |
| 关键词 | 中国沙棘 转录组 SSR 差异基因 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://210.75.249.4/handle/363003/60618 |
| 专题 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 周武,胡娜,刘晓彤,等. 中国沙棘雌雄株叶片RNA-Seq转录组分析[J]. 基因组学与应用生物学,2019,38(12):5516-5526. |
| APA | 周武,胡娜,刘晓彤,王煜伟,&索有瑞.(2019).中国沙棘雌雄株叶片RNA-Seq转录组分析.基因组学与应用生物学,38(12),5516-5526. |
| MLA | 周武,et al."中国沙棘雌雄株叶片RNA-Seq转录组分析".基因组学与应用生物学 38.12(2019):5516-5526. |
| 条目包含的文件 | 下载所有文件 | |||||
| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 中国沙棘雌雄株叶片RNA-Seq转录组分（1979KB） | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 浏览 下载 | |
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