Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
| 多裂骆驼蓬叶片转录组分析 | |
| 夏铭泽; 张雨; 余静雅; 张发起 | |
| 2019 | |
| 发表期刊 | 广西植物
 |
| 页码 | 11 |
| 摘要 | 多裂骆驼蓬为西北荒漠地区常见植物，具有抗风固沙、防止水土流失、抑菌杀虫和抗肿瘤等功效。为了增加骆驼蓬属植物开发利用的强度，弥补其基因功能、代谢通路等分子生物学研究层面的空缺，该研究利用Illumina高通量测序平台对多裂骆驼蓬叶片进行转录组测序，根据测序结果进行转录组数据拼接、功能注释、序列水平和表达水平等分析。本次研究共获得7 723 653 900 bp核苷酸序列信息，拼接组装得到78 641条Unigene，预测出55 535条CDS序列。与多个数据库对比后，获得33 184个NR数据库注释信息；31 835个GO数据库注释信息；17 206个KOG数据库Unigene功能分类信息；7 617个KEGG数据库代谢通路注释信息。对单核苷酸多态性位点和微卫星信息进行检测分析，共发现86 113个SNP位点，6 987个SSR信息。本研究首次获得并分析了多裂骆驼蓬的转录组数据，通过基因比对、CDS预测、通路注释、SNP检测和SSR检测等方法，对该植物的基因、通路以及分子标记等方面有了初步的认识，为本种植物后续研究及资源的开发利用奠定基础。 |
| 关键词 | 多裂骆驼蓬 转录组分析 基因注释 SNP SSR |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://210.75.249.4/handle/363003/60624 |
| 专题 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 夏铭泽,张雨,余静雅,等. 多裂骆驼蓬叶片转录组分析[J]. 广西植物,2019:11. |
| APA | 夏铭泽,张雨,余静雅,&张发起.(2019).多裂骆驼蓬叶片转录组分析.广西植物,11. |
| MLA | 夏铭泽,et al."多裂骆驼蓬叶片转录组分析".广西植物 (2019):11. |
| 条目包含的文件 | 下载所有文件 | |||||
| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 多裂骆驼蓬叶片转录组分析.pdf（787KB） | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 浏览 下载 | |
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