Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
| 高寒灌丛建群种高山绣线菊的低温适应转录组信息分析 | |
| 韩霜; 余静雅; 韩赟; 张发起 | |
| 2022 | |
| 发表期刊 | 中国野生植物资源
 |
| 卷号 | 41期号:08页码:1-7+36 |
| 摘要 | 利用高通量测序技术对高山绣线菊叶片进行转录组测序，获得的转录组数据可用来进行拼接、功能注释、表达水平及差异等分析。组装拼接后获得53 892条Unigenes。与多个数据库进行比对后，31 627条Unigenes成功注释到NR库；16 166条基因注释到KOG数据库，共有26个子类；29 111条注释到GO数据库，注释基因被分为分子功能、生物学过程和细胞组分3大类；3 475条注释到KEGG数据库，涉及的代谢通路可归为四大类，分别是代谢相关通路、遗传信息处理、细胞过程及环境信息处理；此外，共统计到3条与低温胁迫代谢通路相关的主要途径，21条次生代谢途径，1 168条Unigenes，涉及Unigenes数量最多的通路为碳代谢、氨基酸类的生物合成等。该研究旨在筛选高山绣线菊低温胁迫相关代谢通路，挖掘关键基因，对后续其适应低温胁迫分子机制的研究具有一定指导意义。 |
| 关键词 | 高山绣线菊 高通量测序 转录组 低温胁迫 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://210.75.249.4/handle/363003/61451 |
| 专题 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 韩霜,余静雅,韩赟,等. 高寒灌丛建群种高山绣线菊的低温适应转录组信息分析[J]. 中国野生植物资源,2022,41(08):1-7+36. |
| APA | 韩霜,余静雅,韩赟,&张发起.(2022).高寒灌丛建群种高山绣线菊的低温适应转录组信息分析.中国野生植物资源,41(08),1-7+36. |
| MLA | 韩霜,et al."高寒灌丛建群种高山绣线菊的低温适应转录组信息分析".中国野生植物资源 41.08(2022):1-7+36. |
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