Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
当归抽薹关键基因FT和SOC1的生物信息学分析 | |
樊世婷; 李云; 罗香怡; 宗渊; 刘宝龙; 李建民 | |
2022 | |
发表期刊 | 分子植物育种 |
卷号 | 20期号:11页码:3562-3569 |
摘要 | 当归是一种药用价值较高的重要的多年生草本大宗药材,但当归抽薹严重影响其产量和品质,这是限制大规模人工种植栽培当归的关键瓶颈。本研究从当归中克隆到FT和SOC1两个候选基因,并通过序列同源比对分析候选基因与当归抽薹的关联性。结果表明,FT基因全长为528 bp,编码175个氨基酸,生物信息学分析显示,FT蛋白属于不稳定蛋白,在膜外进行作用,主要二级结构形式为延伸链和无规卷曲。SOC1基因共654 bp,编码217个氨基酸,生物信息学分析显示,SOC1蛋白属于不稳定蛋白,主要二级结构形式为α-螺旋和无规则卷曲。发育树聚类显示本研究克隆的FT基因编码的氨基酸序列与胡萝卜FT基因编码的氨基酸序列和胡萝卜亚种栽培种‘heading date 3A-like’蛋白的氨基酸序列均有较高同源性。SOC1基因编码的蛋白与胡萝卜亚种栽培种MADS-box基因家族中SOC1类似蛋白有较高的同源性。综上推测本研究中分离出的FT和SOC1两个基因很有可能与当归开花性状密切相关。本研究结果对解析当归抽薹相关分子机制提供理论参考,为当归的改良育种提供分子依据。 |
关键词 | 当归(Angelica sinensis) FT SOC1 基因克隆 生物信息学分析 |
文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | http://210.75.249.4/handle/363003/61534 |
专题 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 樊世婷,李云,罗香怡,等. 当归抽薹关键基因FT和SOC1的生物信息学分析[J]. 分子植物育种,2022,20(11):3562-3569. |
APA | 樊世婷,李云,罗香怡,宗渊,刘宝龙,&李建民.(2022).当归抽薹关键基因FT和SOC1的生物信息学分析.分子植物育种,20(11),3562-3569. |
MLA | 樊世婷,et al."当归抽薹关键基因FT和SOC1的生物信息学分析".分子植物育种 20.11(2022):3562-3569. |
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