Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
| 青藏高原地区3种蒿属植物转录组比较分析 | |
| 余静雅; 夏铭泽; 徐浩; 张发起 | |
| 2022 | |
| 发表期刊 | 植物研究
 |
| 卷号 | 42期号:02页码:200-210 |
| 摘要 | 米蒿（Artemisia dalai-lamae）、冷蒿（Artemisia frigida）和臭蒿（Artemisia hedinii）作为西北干旱半干旱地区常见植物，具有防风固沙、阻止草原退化、杀菌消炎和治疗多种疾病的功效。通过Illumina测序技术分别对3种蒿属植物进行转录组测序和分析，分别获得54 268 322,46 434 864和43 971 646条Clean reads，并对测序结果进行了SNP和可变剪接分析。在米蒿和冷蒿对比组（ADL vs AF）中筛选到6 107个差异基因，在米蒿和臭蒿对比组（ADL vs AH）中筛选到4 822个差异基因，在冷蒿和臭蒿对比组（AF vs AH）中筛选到3 755个差异基因。GO富集将差异基因注释到生物过程、细胞组成和分子功能这3个类别共47个条目。KEGG代谢通路分析将3个对比组的差异基因分别富集到198、198和197条通路。对每个对比组的前10个高表达差异基因进行了分析，并筛选出25个生物碱、萜类和类黄酮的活性成分可能相关的差异基因。本研究为蒿属植物的物种鉴定、抗逆性研究和资源利用提供一定的科学依据。 |
| 关键词 | 蒿属 转录组比较分析 SNP 可变剪切 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://210.75.249.4/handle/363003/61535 |
| 专题 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 余静雅,夏铭泽,徐浩,等. 青藏高原地区3种蒿属植物转录组比较分析[J]. 植物研究,2022,42(02):200-210. |
| APA | 余静雅,夏铭泽,徐浩,&张发起.(2022).青藏高原地区3种蒿属植物转录组比较分析.植物研究,42(02),200-210. |
| MLA | 余静雅,et al."青藏高原地区3种蒿属植物转录组比较分析".植物研究 42.02(2022):200-210. |
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