Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
| 皱边喉毛花及其近缘种叶绿体基因组结构与进化分析 | |
韩霜 ; 余静雅; 李孝平; 牛玉; 张发起
| |
| 2023 | |
| 发表期刊 | 西北植物学报
 |
| 卷号 | 43期号:10页码:1629-1639 |
| 摘要 | 喉毛花属植物是藏茵陈入药基原植物之一，其属下物种关系一直存在争议。为建立稳定的喉毛花属下系统发育关系，本研究为重建喉毛花属下系统发育关系，通过对皱边喉毛花及其4个近缘种进行Illumina二代测序，共获得12个叶绿体基因组，并分析其结构特征与系统发育关系，为喉毛花属下物种分化研究提供可靠的分子依据。结果表明，(1)皱边喉毛花及其近缘种的叶绿体基因组均在150 kb左右，基因总数均为131个，其中编码基因81个，IR区核苷酸多态性较低，编码区比非编码区更保守；(2)除ndhB基因外，其余编码基因均受到纯化选择的作用，皱边喉毛花及其近缘种的密码子偏好性较弱；(3)基于蛋白编码序列(CDS)、第一、二位密码子位置(CDS~(1+2))、第三位密码子位置(CDS~3)以及筛选出的高度变异基因间隔区(ndhC＿trnV-UAC、psbC＿trnS-UGA和psbK＿psbI)序列等不同数据集构建的系统发育关系高度一致，皱边喉毛花、镰萼喉毛花及长梗喉毛花相互嵌套。总之，皱边喉毛花及其近缘种的叶绿体基因组相似度极高，物种之间存在相互嵌套的系统发育关系。研究可加深对喉毛花属系统发育关系的理解，为喉毛花属下物种分化研究提供可靠的分子依据。 |
| 关键词 | 喉毛花属 叶绿体基因组 密码子偏好性 纯化选择 系统发育 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://210.75.249.4/handle/363003/61729 |
| 专题 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 韩霜,余静雅,李孝平,等. 皱边喉毛花及其近缘种叶绿体基因组结构与进化分析[J]. 西北植物学报,2023,43(10):1629-1639. |
| APA | 韩霜,余静雅,李孝平,牛玉,&张发起.(2023).皱边喉毛花及其近缘种叶绿体基因组结构与进化分析.西北植物学报,43(10),1629-1639. |
| MLA | 韩霜,et al."皱边喉毛花及其近缘种叶绿体基因组结构与进化分析".西北植物学报 43.10(2023):1629-1639. |
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