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中国科学院西北高原生物研究所机构知识库
Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
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研究单元&专题
作者
刘永军 [2]
文献类型
期刊论文 [10]
发表日期
2015 [1]
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2011 [1]
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Theoretical study of the hydrolysis mechanism of 2-pyrone-4,6-dicarboxylate (PDC) catalyzed by LigI
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2015, 卷号: 61, 页码: 21-29
作者:
Zhang, Shujun
;
Ma, Guangcai
;
Liu, Yongjun
;
Ling, Baoping
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提交时间:2015/12/17
Ligi
2-pyrone-4
6-dicarboxylate Lactonase
Qm/mm
2-pyrone-4
Hydrolysis Mechanism
6-dicarboxylate (Pdc)
A QM/MM study of the catalytic mechanism of aspartate ammonia lyase
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2014, 卷号: 51, 页码: 113-119
作者:
Zhang, Jing
;
Liu, Yongjun
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提交时间:2014/12/19
Aspartate Ammonia Lyase
Qm/mm
Mutation
Reaction Mechanism
L-aspartate
Insight into the mechanism of aminomutase reaction: A case study of phenylalanine aminomutase by computational approach
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2013, 卷号: 46, 页码: 65-73
作者:
Wang, Kang
;
Hou, Qianqian
;
Liu, Yongjun
;
Liu, YJ (reprint author), Shandong Univ, Sch Chem & Chem Engn, Key Lab Theoret & Computat Chem Univ Shandong, Jinan 250100, Shandong, Peoples R China.
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提交时间:2014/05/09
Aminomutase
Density Functional Calculations
Enzymatic Reaction Mechanisms
Phenylalanine Aminomutase
Stereochemistry
Theoretical study on the proton shuttle mechanism of saccharopine dehydrogenase
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2013, 卷号: 44, 页码: 17-25
作者:
Sheng, Xiang
;
Gao, Jun
;
Liu, Yongjun
;
Liu, Chengbu
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提交时间:2014/05/09
Saccharopine Dehydrogenase
L-lysine Biosynthesis
Density Functional Theory (Dft) Method
Proton Shuttle
Reaction Mechanism
Theoretical studies on the common catalytic mechanism of transketolase by using simplified models
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2013, 卷号: 39, 页码: 23-28
作者:
Sheng, Xiang
;
Liu, Yongjun
;
Liu, Chengbu
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提交时间:2014/05/09
Transketolase
Density Functional Theory (Dft) Method
Reaction Mechanism
Thdp-dependent Enzyme
2-carbon Fragment Transfer
Molecular dynamics simulations of the coenzyme induced conformational changes of Mycobacterium tuberculosis L-alanine dehydrogenase
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2012, 卷号: 35, 页码: 1-10
作者:
Ling, Baoping
;
Sun, Min
;
Bi, Siwei
;
Jing, Zhihong
;
Liu, Yongjun
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提交时间:2013/03/15
L-alanine Dehydrogenase
Mycobacterium Tuberculosis
Principle Component Analysis
Free Energy Landscape
Molecular Dynamics Simulations
QM/MM studies on the glycosylation mechanism of rice BGlu1 beta-glucosidase
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2011, 卷号: 30, 期号: 14, 页码: 148-152
作者:
Wang, Jinhu
;
Hou, Qianqian
;
Dong, Lihua
;
Liu, Yongjun
;
Liu, Chengbu
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提交时间:2011/12/14
Glycosylation
Beta-glucosidases
Qm/mm
Laminaribiose
Mechanism
Theoretical studies on the interactions of XIAP-BIR3 domain with bicyclic and tricyclic core monovalent Smac mimetics
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2010, 卷号: 29, 期号: 3, 页码: 354-362
作者:
Ling, Baoping
;
Dong, Lihua
;
Zhang, Rui
;
Wang, Zhiguo
;
Liu, Yongjun
;
Liu, Chengbu
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提交时间:2011/12/13
Smac Mimetics
Caspase-9
Xiap-bir3
Molecular Docking
Molecular Dynamics Simulations
Binding Free Energy
Docking and molecular dynamics studies toward the binding of new natural phenolic marine inhibitors and aldose reductase
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2009, 卷号: 28, 期号: 2, 页码: 162-169
作者:
Wang, Zhiguo
;
Ling, Baoping
;
Zhang, Rui
;
Suo, Yourui
;
Liu, Yongjun
;
Yu, Zhangyu
;
Liu, Chengbu
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提交时间:2009/12/24
Phenolic Aris
Aldose Reductase
Molecular Docking
Dynamics
Inhibition
Theoretical studies on the interaction of modified pyrimidines and purines with purine riboswitch
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2009, 卷号: 28, 期号: 1, 页码: 37-45
作者:
Ling, Baoping
;
Wang, Zhiguo
;
Zhang, Rui
;
Meng, Xianghua
;
Liu, Yongjun
;
Zhang, Changqiao
;
Liu, Chengbu
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提交时间:2011/12/13
Pyrimidine
Purine
Purine Riboswitch
Docking
Molecular Dynamics