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中国科学院西北高原生物研究所机构知识库
Knowledge Management System of Northwest Institute of Plateau Biology, CAS
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2014 [1]
2013 [3]
2012 [4]
2011 [1]
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Theoretical study of the hydrolysis mechanism of 2-pyrone-4,6-dicarboxylate (PDC) catalyzed by LigI
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2015, 卷号: 61, 页码: 21-29
作者:
Zhang, Shujun
;
Ma, Guangcai
;
Liu, Yongjun
;
Ling, Baoping
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提交时间:2015/12/17
Ligi
2-pyrone-4
6-dicarboxylate Lactonase
Qm/mm
2-pyrone-4
Hydrolysis Mechanism
6-dicarboxylate (Pdc)
Ring Contraction Catalyzed by the Metal-Dependent Radical SAM Enzyme: 7-Carboxy-7-deazaguanine Synthase from B. multivorans. Theoretical Insights into the Reaction Mechanism and the Influence of Metal Ions
期刊论文
ACS CATALYSIS, 2015, 卷号: 5, 期号: 7, 页码: 3953-3965
作者:
Zhu, Wenyou
;
Liu, Yongjun
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浏览/下载:170/0
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提交时间:2015/12/17
7-carboxy-7-deazaguanine Synthase (Quee)
Reaction Mechanism
7-carboxy-7-deazaguanine (Cdg)
Qm/mm
6-carboxy-5
Sam Radical Enzyme
6
7
8-tetrahydropterin (Cph4)
A QM/MM study of the catalytic mechanism of aspartate ammonia lyase
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2014, 卷号: 51, 页码: 113-119
作者:
Zhang, Jing
;
Liu, Yongjun
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提交时间:2014/12/19
Aspartate Ammonia Lyase
Qm/mm
Mutation
Reaction Mechanism
L-aspartate
QM/MM study on the catalytic mechanism of cyclohexane-1,2-dione hydrolase (CDH)
期刊论文
THEORETICAL CHEMISTRY ACCOUNTS, 2013, 卷号: 133, 期号: 2
作者:
Zhu, Wenyou
;
Liu, Yongjun
;
Liu, YJ (reprint author), Shandong Univ, Sch Chem & Chem Engn, Key Lab Colloid & Interface Chem, Minist Educ, Jinan 250100, Shandong, Peoples R China.
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提交时间:2014/05/09
Cyclohexane-1
Reaction Mechanism
2-dione (Cdo)
Cyclohexane-1
Qm/mm
2-dione Hydrolase (Cdh)
Thiamine Diphosphate (Thdp)-dependent Enzyme
QM/MM study of the conversion mechanism of lysine to methylornithine catalyzed by methylornithine synthase (PylB)
期刊论文
THEORETICAL CHEMISTRY ACCOUNTS, 2013, 卷号: 132, 期号: 9
作者:
Zhu, Wenyou
;
Liu, Yongjun
;
Zhang, Rui
;
Liu, YJ (reprint author), Shandong Univ, Sch Chem & Chem Engn, Key Lab Colloid & Interface Chem, Minist Educ, Jinan 250100, Shandong, Peoples R China.
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提交时间:2014/05/09
Lysine
Methylornithine
Reaction Mechanism
Qm/mm
Methylornithine Synthase (Pylb)
Theoretical study on the deglycosylation mechanism of rice BGlu1 beta-glucosidase
期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY, 2013, 卷号: 113, 期号: 8, 页码: 1071-1075
作者:
Wang, Jinhu
;
Hou, Qianqian
;
Sheng, Xiang
;
Gao, Jun
;
Liu, Yongjun
;
Liu, Chengbu
;
Wang, JH (reprint author), Shandong Univ, Sch Chem & Chem Engn, Minist Educ, Key Lab Colloid & Interface Chem, Jinan 250100, Shandong, Peoples R China.
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提交时间:2014/05/09
Qm
Mm
Deglycosylation
-glucosidases
Laminaribiose
Reaction Mechanism
A QM/MM study on the catalytic mechanism of pyruvate decarboxylase
期刊论文
THEORETICAL CHEMISTRY ACCOUNTS, 2012, 卷号: 131, 期号: 10
作者:
Hou, Qianqian
;
Gao, Jun
;
Liu, Yongjun
;
Liu, Chengbu
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提交时间:2013/03/15
Pyruvate Decarboxylase
Decarboxylation
Protonation State
Combined Qm/mm
Reaction Mechanism
QM/MM investigation on the catalytic mechanism of Bacteroides thetaiotaomicron alpha-glucosidase BtGH97a
期刊论文
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, 2012, 卷号: 1824, 期号: 5, 页码: 750-758
作者:
Wang, Jinhu
;
Sheng, Xiang
;
Zhao, Yi
;
Liu, Yongjun
;
Liu, Chengbu
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提交时间:2013/03/15
Btgh97a
Pnp-glc
Qm/mm
Reaction Mechanism
QM/MM studies on the catalytic mechanism of Phenylethanolamine N-methyltransferase
期刊论文
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, 2012, 卷号: 1824, 期号: 4, 页码: 533-541
作者:
Hou, Q. Q.
;
Wang, J. H.
;
Gao, J.
;
Liu, Y. J.
;
Liu, C. B.
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提交时间:2013/03/15
Qm/mm
Epinephrine
Methyltransferase
Reaction Mechanism
Mutation
QM/MM study of the mechanism of enzymatic limonene 1,2-epoxide hydrolysis
期刊论文
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, 2012, 卷号: 1824, 期号: 2, 页码: 263-268
作者:
Hou, Q. Q.
;
Sheng, X.
;
Wang, J. H.
;
Liu, Y. J.
;
Liu, C. B.
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提交时间:2013/03/15
Qm/mm
Hydrolases
Epoxide Ring-opening
Reaction Mechanism
Mutation